Mach mal folgendes:
sudo -u postgres psql
und schau nach, welchem Benutzer die beiden Datenbanken gehören.
postgres=# \l
(also einfach \l [backslash kleines L] als Befehl und Enter)
Es könnte sein, dass nicht beide Datenbanken dem gleichen Benutzer gehören, weil Du z.B. ein Backup als postgres eingespielt hast und das andere als kivitendo-Benutzer.
/Hannes